寻龙潜山入九重，星斗明华照地宫。
五灵阴阳归元界，天海地阔定苍穹。
——开篇诗
天地初开，万物始发，世界在一片混沌之中渐渐成型，那时有三气游转于天地之间。
一气生于自然，蓬勃而发，转而为元，万物仰天地造化而生，成为元界；一气生于阴暗九冥之地，采幽藏生，转而为阴，化晦暗之力而成，成为阴界；一气生于九天瑞云之巅，取万灵之精，转而为阳，聚灵气纯刚之势而长，成为阳界。
三气化界之时，有两道异气不融于内而旁生两域，一域生于海泽河川之隅，可借水而长，逢水成器，成为渊域；一域生于高寒雪原之处，凭寒而立，擅封气成冰，成为雪域。
不知经过多少岁月，三界两域凭借各自命数蓬勃发展，整个天下分为阳元阴三界，雪渊二域，五大派系各行其道。
但天下大势，久和必有乱，此乃定数。
千年之前，阴界联合两域意图攻下元界进而吞噬阳界，完成三界一统，元界殊死抵抗，并向阳界求救，阳界最终出手与元界结盟，形成两大阵营。
双方展开了数十年的博弈，最终阴界及两域被拖垮战败，至此元气大伤，只能偏安一隅，再未有一战之力，从此，天下在阳元二界的统治之下，生生不息，这次战争史称“千年之战”！
“千年之战”结束之初，三界两域各自领界的边缘之处，都出现了混浊之气，这些混浊之气来历不明却诡异寻常，连阳界的天宗院领袖天行者和元界的太元楼执事长老们都不知道这些混浊之气为何形成。
于是元阳二界派人探查此事，经过对各领界的探查，发现这些混浊之气可侵蚀周围生灵而成长扩大，逐渐形成魔灵，这是一件非常可怕的事情。
经过上次的“千年之战”，阳元二界虽然得胜但也损耗严重，死伤无数，那次大战中三界两域的很多亡魂因未能得到度化荡离于各界阴暗角落，进而化为暴戾之气，但令人意想不到的是这些暴戾之气，竟然可以汲取三界两域的勃发之气聚力而生，再经过百年的自修，幻化成魔灵，成为三界两域之外的异族。
这些魔灵是暴戾邪恶的化身，如果任由这些浑浊之气化为暴戾之气形成的魔灵修行生长，那么它们必然会通过自己的方式回到世间进行复仇，到那时三界两域的五大派系将会就被魔灵控制，后果将是灾难性的！
为了监管三界两域的浑浊之气，避免界域受到侵蚀，为祸天下生灵，阳界天宗院的三大天行者和元界太元楼的五大长老共同商议在阳元交界处的太虚阁设置混元台，将宝灵石置于混元台上吸收日月之光，再由阳界天行宗阳昊和元界大武宗元天分别注入阳魂力和通元力，宝灵石的灵力就会被激活，此灵力便可避免三界两域受到魔灵入侵。
然而宝灵石的灵力虽然可以抑制浑浊之气的侵蚀，但是却阻止不了浑浊之气自修成魔灵，而这些魔灵由于受到宝灵石灵力的压制，也始终无法冲出禁制，只能被困于界域的阴晦寒暗之处。
自上次天行宗阳昊和大武宗元天给灵石注入神力后已经过去二百年，经过岁月的催化，宝灵石的灵力在渐渐衰退，而那些浑浊之气正是魔灵的初始混元体。
在这期间混浊之气可渐化为魔灵，灵石的灵力与魔灵的魔气是此消彼长的，灵力越弱，魔气越重，而且魔气还会侵扰灵气，宝灵石上便会出现裂痕。待到宝灵石灵力完全耗尽时，随即碎裂，再也无法抑制魔灵，魔灵出世，那时三界两域的所有生灵必然会遭受一场旷世不遇的浩劫，所以故事就从这里开始发生了！